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Data di pubblicazione Titolo Autore/i Tipologia Documento allegato
1-gen-2009 Computing with energy and chemical reactions Leporati, Alberto; Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Pescini, Dario; Ferretti, Claudio 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2009 (Tissue) P systems with cell polarity Besozzi, Daniela; Busi, Nadia; Cazzaniga, Paolo; Ferretti, Claudio; Leporati, Alberto; Mauri, Giancarlo; Pescini, Dario; Zandron, Claudio 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2009 A comparison of genetic algorithms and particle swarm optimization for parameter estimation in stochastic biochemical systems Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Mauri, Giancarlo; Pescini, Dario; Vanneschi, Leonardo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2009 A multi-volume approach to stochastic modeling with membrane systems Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo 1.2 Contributi in volume - Book chapters::1.2.01 Contributi in volume (Capitoli o Saggi) - Book Chapters/Essays
1-gen-2009 First Steps Towards a Wet Implementation for τ-DPP Pescini, Dario; Cazzaniga, Paolo; Ferretti, Claudio; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2009 Stochastic simulations on a grid framework for parameter sweep applications in biological models Mosca, Ettore; Merelli, Ivan; Milanesi, Luciano; Cazzaniga, Paolo; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2010 Modelling spatial heterogeneity and macromolecular crowding with membrane systems Mosca, Ettore; Cazzaniga, Paolo; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo; Milanesi, Luciano 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2010 BioSimWare: A software for the modeling, simulation and analysis of biological systems Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Mauri, Giancarlo; Pescini, Dario 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2010 A novel variant of P systems for the modelling and simulation of biochemical systems Cazzaniga, Paolo; Mauri, Giancarlo; Milanesi, Luciano; Mosca, Ettore; Pescini, Dario 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2011 Investigating oscillatory regimes in the Ras/cAMP/PKA pathway in S. cerevisiae: the role of feedback control mechanisms Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo; Colombo, Sonia; Martegani, Enzo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2011 The role of Ras modulators and feedback control mechanisms on the establishment of oscillations in the Ras/cAMP/PKA pathway in S. cerevisiae Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo; Colombo, Sonia; Martegani, Enzo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.03 Testi di poster in atti di convegno - Conference posters
1-gen-2011 Grid computing for sensitivity analysis of stochastic biological models Merelli, Ivan; Pescini, Dario; Mosca, Ettore; Cazzaniga, Paolo; Maj, Carlo; Mauri, Giancarlo; Milanesi, Luciano 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2011 Modeling diffusion in a signal transduction pathway: The use of virtual volumes in p systems Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Cocolo, Stefania; Mauri, Giancarlo; Pescini, Dario 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2012 The role of feedback control mechanisms on the establishment of oscillatory regimes in the Ras/cAMP/PKA pathway in S. cerevisiae Computational Systems Biology Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo; Colombo, Sonia; Martegani, Enzo 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2012 A GPU-based Multi-Swarm PSO Method for Parameter Estimation in Stochastic Biological Systems Exploiting Discrete-Time Target Series Nobile, MARCO S.; Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Mauri, Giancarlo; Pescini, Dario 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2012 Estimating reaction constants in stochastic biological systems with a multi-swarm PSO running on GPUs Nobile, Marco S.; Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Mauri, Giancarlo; Pescini, Dario 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.02 Abstract in atti di convegno - Conference abstracts
1-gen-2012 Simulation of the Ras/cAMP/PKA pathway in budding yeast highlights the establishment of stable oscillatory states Pescini, Dario; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Mauri, Giancarlo; Amigoni, Loredana; Colombo, Sonia; Martegani, Enzo 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2013 GPU-powered sensitivity analysis and parameter estimation of a reaction-based model of the Post Replication Repair pathway in yeast Cazzaniga, Paolo; Colombo, Riccardo; Nobile, MARCO S.; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo; Besozzi, Daniela 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.03 Testi di poster in atti di convegno - Conference posters
1-gen-2013 A GPU-powered computational analysis of PCNA ubiquitylation processes involved in UV-induced DNA lesions bypass Besozzi, Daniela; Colombo, Riccardo; Cazzaniga, Paolo; Nobile, MARCO S.; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.03 Testi di poster in atti di convegno - Conference posters
1-gen-2013 Accelerating the computational analysis of biological systems by means of Graphics Processing Units Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Colombo, Riccardo; Mauri, Giancarlo; Nobile, MARCO S.; Pescini, Dario 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.03 Testi di poster in atti di convegno - Conference posters
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