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Data di pubblicazione Titolo Autore/i Tipologia Documento allegato
1-gen-2013 cupSODA: a CUDA-powered simulator of mass-action kinetics Nobile, MARCO S.; Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Mauri, Giancarlo; Pescini, Dario 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2013 GPU-powered simulation methodologies for biological systems Besozzi, Daniela; Caravagna, G.; Cazzaniga, Paolo; Nobile, MARCO S.; Pescini, Dario; Re, Alessandro 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2013 The foundation of Evolutionary Petri Nets Nobile, MARCO S.; Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2013 Reverse engineering of kinetic reaction networks by means of Cartesian Genetic Programming and Particle Swarm Optimization Nobile, MARCO S.; Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2013 In vivo and in silico analysis of PCNA ubiquitylation in the activation of the Post Replication Repair pathway in S. cerevisiae Amara, Flavio; Colombo, Riccardo; Cazzaniga, Paolo; Pescini, Dario; CSIKCÁSZ NAGY, Attila; MUZI FALCONI, Marco; Besozzi, Daniela; Plevani, Paolo 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2014 Modeling and simulation of the blood coagulation cascade Bellini, Matteo; Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Mauri, Giancarlo; Nobile, MARCO S. 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2014 Molecular diffusion and compartmentalization in signal transduction pathways: an application of membrane systems to the study of bacterial chemotaxis Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo 1.2 Contributi in volume - Book chapters::1.2.01 Contributi in volume (Capitoli o Saggi) - Book Chapters/Essays
1-gen-2014 A memetic hybrid method for the Molecular Distance Geometry Problem with incomplete information Nobile, MARCO S.; Citrolo, A. G.; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2014 Simulation and analysis of the blood coagulation cascade accelerated on GPU Bellini, Matteo; Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Mauri, Giancarlo; Nobile, MARCO S. 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2014 Massive exploration of perturbed conditions of the blood coagulation cascade through GPU parallelization Cazzaniga, Paolo; Nobile, MARCO S.; Besozzi, Daniela; Bellini, Matteo; Mauri, Giancarlo 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2014 cuTauLeaping: a GPU-powered tau-leaping stochastic simulator for massive parallel analyses of biological systems Nobile, MARCO S.; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Pescini, Dario; Mauri, Giancarlo 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2014 Computational strategies for a system-level understanding of metabolism Cazzaniga, Paolo; Damiani, Chiara; Besozzi, Daniela; Colombo, Riccardo; Nobile, MARCO S.; Gaglio, Daniela; Pescini, Dario; Molinari, Sara; Mauri, Giancarlo; Alberghina, Lilia; Vanoni, Marco 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2014 GPU-accelerated simulations of mass-action kinetics models with cupSODA Nobile, MARCO S.; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Mauri, Giancarlo 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2015 GPU computing for accelerated analyses of a large-scale model of cell fate in cancer cells Nobile, Marco S.; Harris, Leonard; Shockley, Erin; Pino, James C.; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Lopez, Carlos F.; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.03 Testi di poster in atti di convegno - Conference posters
1-gen-2015 GPU-powered sensitivity analysis of a large-scale model of death cell signaling and proliferation in cancer cells Nobile, Marco S.; Harris, Leonard; Shockley, Erin; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Lopez, Carlos F.; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.02 Abstract in atti di convegno - Conference abstracts
1-gen-2015 Towards a GPU-powered toolbox for the computational analysis of biological systems Cazzaniga, Paolo; Nobile, Marco S.; Besozzi, Daniela; Citrolo, Andrea G.; Tangherloni, Andrea; Donizetti, Alberto; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.03 Testi di poster in atti di convegno - Conference posters
1-gen-2015 The impact of particles initialization in PSO: Parameter estimation as a case in point Cazzaniga, Paolo; Nobile, Marco S.; Besozzi, Daniela 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2015 Proactive Particles in Swarm Optimization: A self-tuning algorithm based on Fuzzy Logic Nobile, Marco S.; Pasi, Gabriella; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Colombo, Riccardo; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2015 Parallelizing Biochemical Stochastic Simulations: A Comparison of GPUs and Intel Xeon Phi Processors Cazzaniga, Paolo; Ferrara, F.; Nobile, M. S.; Besozzi, D.; Mauri, G. 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2016 GPU-powered Bat Algorithm for the parameter estimation of biochemical kinetic values Tangherloni, Andrea; Nobile, Marco S.; Cazzaniga, Paolo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
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