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Data di pubblicazione Titolo Autore/i Tipologia Documento allegato
1-gen-2016 GPU-powered evolutionary design of mass-action-based models of gene regulation Nobile, Marco S.; Cipolla, Davide; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela 1.2 Contributi in volume - Book chapters::1.2.01 Contributi in volume (Capitoli o Saggi) - Book Chapters/Essays
1-gen-2016 GPU-powered Bat Algorithm for the parameter estimation of biochemical kinetic values Tangherloni, Andrea; Nobile, Marco S.; Cazzaniga, Paolo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2016 GPU-powered and settings-free parameter estimation of biochemical systems Nobile, Marco S.; Tangherloni, Andrea; Besozzi, Daniela; Cazzaniga, Paolo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2017 Graphics processing units in bioinformatics, computational biology and systems biology Nobile, Marco S; Cazzaniga, Paolo; Tangherloni, Andrea; Besozzi, Daniela 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2017 GPU-powered model analysis with PySB/cupSODA Harris, Leonard A; Nobile, Marco S; Pino, James C; Lubbock, Alexander L. R; Besozzi, Daniela; Mauri, Giancarlo; Cazzaniga, Paolo; Lopez, Carlos F. 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2017 COSYS: A computational infrastructure for systems biology Cumbo, Fabio; Nobile, Marco S.; Damiani, Chiara; Colombo, Riccardo; Mauri, Giancarlo; Cazzaniga, Paolo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2017 Reboot strategies in particle swarm optimization and their impact on parameter estimation of biochemical systems Spolaor, Simone; Tangherloni, Andrea; Rundo, Leonardo; Nobile, Marco S.; Cazzaniga, Paolo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2017 Efficient simulation of reaction systems on graphics processing units Nobile, Marco S.; Porreca, Antonio E.; Spolaor, Simone; Manzoni, Luca; Cazzaniga, Paolo; Mauri, Giancarlo; Besozzi, Daniela 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2017 Gillespie’s Stochastic Simulation Algorithm on MIC coprocessors Tangherloni, Andrea; Nobile, Marco S.; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Mauri, Giancarlo 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
10-mag-2017 LASSIE: simulating large-scale models of biochemical systems on GPUs Tangherloni, Andrea; Nobile, Marco S.; Besozzi, Daniela; Mauri, Giancarlo; Cazzaniga, Paolo 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2018 Fuzzy Self-Tuning PSO: A settings-free algorithm for global optimization Nobile, Marco S.; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Colombo, Riccardo; Mauri, Giancarlo; Pasi, Gabriella 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2018 Computational Intelligence for Parameter Estimation of Biochemical Systems Nobile, Marco S.; Tangherloni, Andrea; Rundo, Leonardo; Spolaor, Simone; Besozzi, Daniela; Mauri, Giancarlo; Cazzaniga, Paolo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2018 GPU-Powered Multi-Swarm Parameter Estimation of Biological Systems: A Master-Slave Approach Tangherloni, Andrea; Rundo, Leonardo; Spolaor, Simone; Cazzaniga, Paolo; Nobile, Marco S. 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2019 GPU Accelerated Analysis of Treg-Teff Cross Regulation in Relapsing-Remitting Multiple Sclerosis Beccuti, Marco; Cazzaniga, Paolo; Pennisi, Marzio; Besozzi, Daniela; Nobile, Marco S.; Pernice, Simone; Russo, Giulia; Tangherloni, Andrea; Pappalardo, Francesco 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2019 High Performance Computing for Haplotyping: Models and Platforms Tangherloni, Andrea; Rundo, Leonardo; Spolaor, Simone; Nobile, Marco S.; Merelli, Ivan; Besozzi, Daniela; Mauri, Giancarlo; Cazzaniga, Paolo; Liò, Pietro 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2019 HaraliCU: GPU-powered Haralick feature extraction on medical images exploiting the full dynamics of gray-scale levels Rundo, Leonardo; Tangherloni, Andrea; Galimberti, Simone; Cazzaniga, Paolo; Woitek, Ramona; Sala, Evis; Nobile, Marco S.; Mauri, Giancarlo 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
1-gen-2019 Biochemical parameter estimation vs. benchmark functions: A comparative study of optimization performance and representation design Tangherloni, Andrea; Spolaor, Simone; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Rundo, Leonardo; Mauri, Giancarlo; Nobile, Marco S. 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2019 Modeling cell proliferation in human acute myeloid leukemia xenografts Nobile, Marco S.; Vlachou, Thalia; Spolaor, Simone; Bossi, Daniela; Cazzaniga, Paolo; Lanfrancone, Luisa; Mauri, Giancarlo; Pelicci, Pier Giuseppe; Besozzi, Daniela 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2019 ginSODA: massive parallel integration of stiff ODE systems on GPUs Nobile, Marco S.; Cazzaniga, Paolo; Besozzi, Daniela; Mauri, Giancarlo 1.1 Contributi in rivista - Journal contributions::1.1.01 Articoli/Saggi in rivista - Journal Articles/Essays
1-gen-2019 Dilation Functions in Global Optimization Nobile, Marco S.; Cazzaniga, Paolo; Ashlock, Daniel A. 1.4 Contributi in atti di convegno - Contributions in conference proceedings::1.4.01 Contributi in atti di convegno - Conference presentations
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